Sau khi Ban Bí thư (khoá IX) ban hành các quy định về chức năng, nhiệm vụ của các loại hình tổ chức cơ sở đảng (TCCSĐ), các tỉnh, thành uỷ, đảng uỷ trực thuộc Trung ương đều xây dựng kế hoạch, có văn bản chỉ đạo các cấp ủy trực thuộc tổ chức quán triệt, triển khai thực hiện. Một số tỉnh, thành uỷ đã đưa nội dung các quy định của Ban Bí thư vào chương trình đào tạo, bồi dưỡng, tập huấn cho cán bộ và cấp ủy cơ sở tại trường chính trị tỉnh, thành phố, trung tâm bồi dưỡng chính trị cấp huyện. Không ít tỉnh, thành phố cho đăng tải trên các phương tiện thông tin đại chúng của địa phương để cán bộ, đảng viên và nhân dân biết, tham gia giám sát việc thực hiện. Đảng ủy Quân sự Trung ương đã chỉ đạo các cấp ủy trong toàn quân nghiên cứu, quán triệt các quy định của Ban Bí thư; chỉ đạo Tổng cục Chính trị có hướng dẫn cụ thể cho từng loại hình TCCSĐ. Nhiều tỉnh, thành ủy và cấp uỷ cấp trên trực tiếp của TCCSĐ đã tổ chức các lớp bồi dưỡng nghiệp vụ, tập huấn nội dung các quy định của Ban Bí thư cho cán bộ các ban xây dựng đảng, đội ngũ cấp uỷ viên cơ sở theo các loại hình, đồng thời chỉ đạo việc tổ chức, quán triệt tới các chi bộ.

Đến cuối năm 2006, có 20/25 quy định của Ban Bí thư ban hành trong năm 2004 và năm 2005 đã được phổ biến, quán triệt đến cơ sở. Trong đó, các quy định về chức năng, nhiệm vụ của đảng bộ, chi bộ cơ sở xã, phường, thị trấn,  doanh nghiệp nhà nước, đơn vị sự nghiệp, cơ quan và lực lượng vũ trang đã được triển khai đến hầu hết các TCCSĐ. Thông qua việc học tập, quán triệt các quy định của Ban Bí thư đã góp phần nâng cao nhận thức cho các cấp uỷ và đảng viên về vị trí, vai trò hạt nhân chính trị của TCCSĐ; nắm vững hơn chức năng, nhiệm vụ của TCCSĐ, nhất là những điểm mới trong các quy định để vận dụng thực hiện cho phù hợp với từng đảng bộ, chi bộ cơ sở.

Hầu hết các tỉnh, thành uỷ đều cụ thể hóa 5 nhiệm vụ của TCCSĐ trong quy định của Ban Bí thư thành những nội dung cụ thể, phù hợp với từng loại hình TCCSĐ; một số nơi in thành sách hoặc sổ tay đảng viên và phát hành rộng rãi tới cấp uỷ viên ở cơ sở. Phần lớn cấp uỷ cơ sở đã rà soát, bổ sung và hoàn thiện quy chế làm việc cho phù hợp với tình hình, đặc điểm của đảng bộ, chi bộ; xác định rõ mối quan hệ công tác giữa cấp ủy với các tổ chức có liên quan trong hệ thống chính trị ở cơ sở như: Mối quan hệ giữa cấp ủy với HĐND, UBND và các đoàn thể chính trị-xã hội ở xã, phường, thị trấn; giữa cấp ủy với hội đồng quản trị, tổng giám đốc (giám đốc) trong các loại hình doanh nghiệp; giữa cấp ủy với thủ trưởng cơ quan, đơn vị v.v... Trên cơ sở quy chế làm việc của tổ chức đảng, nhiều cấp uỷ đã chỉ đạo chính quyền, các đoàn thể chính trị-xã hội bổ sung, sửa đổi quy chế làm việc, tạo sự đồng bộ, thống nhất trong hoạt động của các tổ chức trong hệ thống chính trị ở cơ sở. 

Các quy định của Ban Bí thư về chức năng, nhiệm vụ của TCCSĐ được các cấp uỷ chỉ đạo, nghiên cứu, quán triệt và tổ chức thực hiện khá nghiêm túc. Hầu hết các cấp ủy đều cho rằng: Các quy định của Ban Bí thư là văn bản pháp lý quan trọng, có tác dụng định hướng hoạt động cho các TCCSĐ. Nội dung các quy định cụ thể, rõ ràng, cơ bản phù hợp với thực tiễn, giúp cho cấp uỷ và đảng viên ở cơ sở nắm vững hơn chức năng, nhiệm vụ của đảng bộ, chi bộ; làm căn cứ để cấp ủy cơ sở xây dựng, bổ sung hoàn thiện quy chế làm việc, cụ thể hoá nội dung, phương thức lãnh đạo cho phù hợp.

Tuy thời gian thực hiện các quy định của Ban Bí thư chưa nhiều, nhưng nhìn chung các TCCSĐ có chuyển biến về nhận thức, phát huy tốt hơn vai trò hạt nhân chính trị ở cơ sở, từng bước khắc phục tình trạng bao biện làm thay hoặc buông lỏng vai trò lãnh đạo của tổ chức đảng, thực hiện tốt hơn cơ chế Đảng lãnh đạo, Nhà nước quản lý, nhân dân làm chủ, góp phần thúc đẩy thực hiện các nhiệm vụ chính trị của địa phương, đơn vị, tạo được một số chuyển biến tích cực trong công tác xây dựng đảng. Cùng với việc coi trọng công tác lãnh đạo thực hiện nhiệm vụ chính trị, nhiều cấp uỷ đã coi trọng việc quản lý, theo dõi và phân công nhiệm vụ cho đảng viên, có chuyển biến tích cực trong đào tạo, bồi dưỡng tạo nguồn kết nạp đảng viên. Việc triển khai và tổ chức thực hiện ở các loại hình cơ sở tuy kết quả có khác nhau, nhưng nhìn chung đã tạo được sự chuyển biến tiến bộ hơn so với trước.    

Trên 90% số đảng bộ, chi bộ và cấp uỷ cơ sở đã xây dựng hoặc bổ sung, sửa đổi quy chế hoạt động. Các quy chế đã thể hiện rõ hơn chức năng, nhiệm vụ và mối quan hệ công tác của tổ chức đảng, cấp uỷ với chính quyền và các đoàn thể quần chúng. Kết quả thực hiện chức năng, nhiệm vụ theo quy định của Ban Bí thư giúp cho các cấp ủy cấp trên xem xét, đánh giá chất lượng tổ chức đảng và đảng viên hằng năm được khách quan, sát, đúng hơn.     

Các cấp uỷ cấp trên đã quan tâm chăm lo hơn đến TCCSĐ, có những chủ trương, giải pháp và chính sách để tiếp tục xây dựng các loại hình TCCSĐ trong sạch, vững mạnh.

Tuy nhiên, một số cấp uỷ chưa coi trọng đúng mức việc quán triệt các quy định của Ban Bí thư cho cán bộ, đảng viên. Một số nơi triển khai đến cơ sở còn chậm, không tổ chức quán triệt và hướng dẫn cụ thể đối với từng loại hình TCCSĐ, chỉ sao chụp các quy định của Ban Bí thư gửi xuống cấp dưới để thực hiện; công tác kiểm tra của cấp ủy cấp trên thiếu thường xuyên, vì vậy, nhiều cấp uỷ cơ sở hiểu và vận dụng chưa đúng nội dung quy định…

 Việc tổ chức thực hiện quy định của Ban Bí thư ở một số loại hình TCCSĐ kết quả còn hạn chế. Nhiều TCCSĐ trong doanh nghiệp tư nhân, doanh nghiệp liên doanh và doanh nghiệp 100% vốn nước ngoài chưa thể hiện rõ vai trò hạt nhân chính trị, lúng túng trong việc xác định nội dung và phương thức lãnh đạo, nhất là lãnh đạo thực hiện nhiệm vụ chính trị, công tác cán bộ và xác định mối quan hệ giữa cấp uỷ với hội đồng quản trị, giám đốc...

Việc xây dựng quy chế hoạt động ở một số đảng bộ, chi bộ còn chung chung, thiếu cụ thể; sau đại hội hoặc khi chuyển đổi chế độ sở hữu (cổ phần hoá) chậm bổ sung, sửa đổi quy chế làm việc.

Việc thực hiện chế độ tự phê bình và phê bình trong sinh hoạt đảng còn yếu và hình thức; số đảng viên vi phạm pháp luật trong lĩnh vực quản lý kinh tế có chiều hướng gia tăng nhưng phần lớn không được đấu tranh, phát hiện từ chi bộ, mà chủ yếu do quần chúng tố cáo, cơ quan thanh tra, kiểm tra kết luận hoặc báo chí phát hiện.

Nhiều xã, phường, thị trấn chưa quan tâm công tác đào tạo, bồi dưỡng, tạo nguồn cán bộ trẻ, cán bộ nữ, cán bộ người dân tộc thiểu số tại chỗ; việc tổ chức cho quần chúng tham gia, đóng góp ý kiến về sự lãnh đạo của tổ chức đảng và vai trò tiền phong gương mẫu của cán bộ, đảng viên hằng năm, nhất là cán bộ chủ chốt chưa được tiến hành thường xuyên, còn hình thức nên tác dụng và hiệu quả thấp.

Để thực hiện tốt các quy định của Ban Bí thư về chức năng, nhiệm vụ của TCCSĐ, các cấp ủy đảng cần tập trung chỉ đạo và thực hiện tốt một số nội dung sau:

1. Cùng với việc triển khai thực hiện Chỉ thị 06-CT/TW của Bộ Chính trị về “Cuộc vận động học tập và làm theo tấm gương đạo đức Hồ Chí Minh”, Chỉ thị số 10-CT/TW của Ban Bí thư về “Nâng cao chất lượng sinh hoạt chi bộ”, các cấp ủy tiếp tục chỉ đạo việc nghiên cứu, quán triệt quy định của Ban Bí thư về chức năng, nhiệm vụ của các loại hình TCCSĐ trong các cấp uỷ và đội ngũ cán bộ, đảng viên ở cơ sở; đưa nội dung các quy định của Ban Bí thư vào chương trình đào tạo, bồi dưỡng ở các trường chính trị tỉnh và trung tâm bồi dưỡng chính trị cấp huyện, đồng thời tổ chức các lớp tập huấn nghiệp vụ cho đội ngũ cán bộ chủ chốt và cấp ủy viên ở cơ sở.

2. Các cấp ủy cấp trên của TCCSĐ cần tiếp tục cụ thể hoá nội dung trong các quy định của Ban Bí thư thành những nhiệm vụ cụ thể, phù hợp với chức năng, nhiệm vụ của từng loại hình TCCSĐ. Thường xuyên theo dõi, định kỳ kiểm tra, giám sát việc tổ chức thực hiện, kịp thời phát hiện, uốn nắn, khắc phục những biểu hiện sai sót, lệch lạc ở cơ sở. Chỉ đạo các cấp uỷ cơ sở tiếp tục rà soát, bổ sung, sửa đổi và hoàn thiện hệ thống quy chế làm việc cho phù hợp với tính chất, đặc điểm hoạt động cụ thể của từng loại hình TCCSĐ.

3. Tăng cường chỉ đạo việc xây dựng, củng cố tổ chức đảng, các đoàn thể quần chúng và kết nạp đảng viên trong các doanh nghiệp tư nhân, doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài theo tinh thần Chỉ thị 07-CT/TW của Bộ Chính trị khóa VIII; rà soát và chuyển sinh hoạt đảng đối với những đảng viên đã có hợp đồng làm việc ổn định, lâu dài về sinh hoạt đảng ở doanh nghiệp để tham gia xây dựng tổ chức đảng và thực hiện nhiệm vụ đảng viên. Cấp uỷ cấp trên cần lựa chọn, bố trí đủ cán bộ chuyên trách công tác đảng theo Hướng dẫn số 03-HD/BTCTW của Ban Tổ chức Trung ương; hướng dẫn các cơ sở vận dụng thực hiện Quyết định số 84-QĐ/TW của Ban Bí thư khóa IX về “Quy định chế độ chi hoạt động công tác đảng của tổ chức đảng các cấp”; tăng cường bồi dưỡng nghiệp vụ cho đội ngũ cán bộ làm công tác đảng, đoàn thể trong các doanh nghiệp ngoài quốc doanh.

4. Tăng cường công tác đào tạo, bồi dưỡng, nâng cao trình độ mọi mặt cho cán bộ chủ chốt và đội ngũ cấp uỷ viên cơ sở; bố trí đúng bí thư cấp uỷ, tích cực tạo nguồn và tuyển chọn, tiếp nhận những cán bộ trẻ, đã được đào tạo cơ bản, có trình độ chuyên môn, nghiệp vụ về công tác ở cơ sở xã, phường, thị trấn, các doanh nghiệp. Có kế hoạch cụ thể để thực hiện chủ trương không còn những đơn vị chưa có tổ chức đảng và đảng viên.

5. Tiếp tục nghiên cứu, bổ sung, sửa đổi một số chế độ, chính sách đối với cán bộ, công chức cơ sở xã, phường, thị trấn cho phù hợp với thực tiễn hiện nay; sớm bổ sung chức danh văn phòng đảng uỷ xã, phường, thị trấn và thực hiện chế độ phụ cấp trách nhiệm đối với cấp uỷ viên ở các cấp.